当美国进步派杂志《新共和》(The New Republic)和保守派非营利全国学者联合会(National Association of Scholars)也曾警告,孔子学院就是中共对美施加「软实力作战」的主要机构。
专栏作家费希(Isaac Stone Fish)曾在《新共和》撰文称,一些美国大学将特定「会触犯中国共产党」的议题中过滤后才教给学生,比如1958年至1962年的大跃进导致3千万至5千万中国人死亡等禁忌话题,连顶尖的大学都无法免疫。哥伦比亚大学在北京的全球中心曾以「害怕触怒中共官员」为由取消演讲,北卡罗来纳州立大学(North Carolina State University)取消达赖喇嘛访问等。